滨州港务集团有限责任公司作为滨州港建设主体，是一家集投融资、建设、运营、管理于一体的国有大型企业集团，前身是2006年2月成立的滨州港务有限责任公司。2014年，为了进一步加快滨州港建设步伐，实现政企分开，滨州市委、市进行了重大战略性调整，在原滨州港务有限责任公司的基础上，通过资产重组、增资扩股组建成立滨州港务集团有限责任公司，统一协调和管理港口建设，承担滨州港建设开发乃至滨州市经济转型的重担。2014年5月20日，滨州港务集团有限责任公司正式挂牌成立。集团初创期直属综合管理部、财务部、融资部、运营发展部、规划建设部、工程技术部、安全质量环保部七个部室，集团下设滨州港服务有限公司、滨州港渔业发展有限公司、黄河三角洲（滨州）港口管理运营有限责任公司三家全资子公司，并与青岛港国际股份有限公司共同投资成立滨州港青港国际码头有限公司，与山东滨州交运集团有限公司、山东黄河三角洲能源贸易有限公司共同投资成立滨州港物流有限公司。