闽江口内港区目前是福州港的主体。现有港口设施主要分布于台江、马尾、青州、筹东、松门、长安等作业区。目前开辟的主要航线有至香港、日本、韩国、高雄、新加坡等近洋航线。港区承担福州港能源物资、矿建材料、件杂货、沿海及近洋集装箱运输。长安作业区是闽江口内尚未开发的黄金岸线。规划岸线长约3200米，可建停靠第二代集装箱船泊位7个，万吨级通用泊位6个，预计可形成杂货通过能力450万吨，集装箱吞吐能力90万TEU。